Die Stadt Młynary und ihre Gegend ist von den schönen Landschaften umgegeben. 37 Prozent der Gemeindefläche sind Wälder. Hier befindet sich ein Naturschutzgebiet "Straussfarnschlucht" und "Lenki". Durch das Gemeinde fließt ein Fluss Bauda. Im Stromgebiet von Bauda befindet sich das Landschaftschutzgebiet. Außerdem in den vielen Dörfern am Fluss kann man Biberkolonien beobachten. Das zeigt davon, dass die Biber in der Gegend zahlreich auftreten. Der Fluss Bauda, Okrzejka, Lisi Parów und Gardyna machen die Landschaft noch schöner.
In der Gemeinde gibt es folgende Schutzgebiete:
Das Naturschutzgebiet „Lenki“ – Teilnaturschutzgebiet von der Fläche 9,74 Hektar; wurde am 31 Oktober 1959 gegründet; liegt auf dem Gebiet des Forstamtes Młynary und Sąpy. Das Naturschutzgebiet ist zum Bewahren des Lärchen- und Buchenaltholzes entstanden.
Das Naturschutzgebiet "Straussfarnschlucht" - Teilnaturschutzgebiet von der Fläche 37,78 Hektar (darunter 24,40 Hektar befindet sich auf dem Gebiet der Gemeinde Młynary); wurde am 28 Juli 1962 gegründet; liegt auf dem Gebiet des Forstamtes Elbląg; das Gebiet wurde unter Schutz genommen, um den malerischen Misch- und Bruchwald mit den Stellen von seltsamen Straußfarn zu bewahren.
Das Landschaftschutzgebiet Bauda – wurde am 26 April 1985 gegründet; das Landschaftschutzgebiet ist zum Bewahren der östlichen Hängen der Elbinger Hochebene, des Flusses und Waldes entstanden.
Das Landschaftschutzgebiet in Słobity – wurde am 26 April 1985 zum Bewahren der Landschaft des Ermländischen Flachlandes gegründet
